Escherichia coli patojenik suşları

Genel açıklama

Escherichia coli, normalde insan ve hayvanların bağırsak florasında büyük miktarlarda bulunur ve genellikle herhangi bir zarara neden olmaz. Bununla birlikte, vücudun diğer bölgelerinde E. coli idrar yolu enfeksiyonları, bakteriüri ve menenjit gibi ciddi hastalıklara neden olabilir. Sınırlı sayıda enteropatojenik suş akut ishale neden olabilir. Enterohemorajik E. coli (EHEC), enterotoksin üreten E. coli (ETEC), enteropatojenik E. coli (EPEC), enteroinvaziv E. coli (EIEC), enteroagregatif E. coli (EAEC) ve difüz yapışık E. coli (DAEC) dahil olmak üzere farklı virülens faktörlerine göre sınıflandırılmış birden fazla enteropatojenik E. coli türü tanımlanmıştır. Adı geçen ilk dört sınıf hakkında daha fazla bilgi bulunmaktadır; EAEC ve DAEC suşlarının patojenite ve prevalansı daha az belirgindir.

İnsan sağlığına etkileri

EHEC (Enterohemorajik E. coli):

• E. coli O157:H7 ve E. coli O111 gibi EHEC serotipleri, hafif ve kansız ishalden hemorajik kolit ile ayırt edilemeyen şiddetli kanlı ishale kadar değişen aralıkta bir ishale neden olur.
• Vakaların %2 ila %7’sinde, akut böbrek yetmezliği ve hemolitik anemi ile karakterize olan, potansiyel olarak ölümcül hemolitik üremik sendrom gelişebilir.
• 5 yaşın altındaki çocuklar, hemolitik üremik sendrom geliştirme riski en yüksek olan gruptur.
• EHEC suşlarının bulaşıcılığı diğer suşlardan önemli ölçüde daha yüksektir. Aslında, sadece 100 kadar EHEC organizması enfeksiyona neden olabilir.

ETEC (Enterotoksin Üreten E. coli):

• ETEC, ısıya duyarlı veya ısıya dayanıklı E. coli enterotoksini veya her iki toksini aynı anda üretir ve özellikle küçük çocuklarda, gelişmekte olan ülkelerde ishalin önemli bir sebebidir.
• ETEC enfeksiyonunun semptomları arasında hafif sulu ishal, karın krampları, mide bulantısı ve baş ağrısı bulunur.

EPEC (Enteropatojenik E. coli):

• EPEC enfeksiyonu, bebeklerde şiddetli, kronik, kanlı olmayan ishal, kusma ve ateş ile ilişkilendirilmiştir.
• EPEC enfeksiyonları gelişmiş ülkelerde nadirdir, ancak yetersiz beslenme, kilo kaybı ve büyüme geriliği ile ortaya çıkan bebeklerde, gelişmekte olan ülkelerde yaygındır.

EIEC (Enteroinvaziv E. coli):

• EIEC, Shigella’ya benzer bir patojenik mekanizma ile kolon hücrelerini istila ederek, sulu ve bazen kanlı ishale neden olur.

Enteropatojenik E. coli’nin Kaynağı ve Bulunma Yeri

Enteropatojenik E. coli enterik organizmalardır ve insanlar, özellikle EPEC, ETEC ve EIEC suşları için en büyük rezervuarı oluşturur. Sığır ve koyun gibi büyükbaş hayvanlar ve daha az ölçüde keçi, domuz ve tavuk gibi çiftlik hayvanları, EHEC suşlarının ana kaynağıdır. EHEC suşları ayrıca fasulye filizi gibi çiğ sebzelerle de ilişkilendirilmiştir. Bu patojenler çeşitli su ortamlarında tespit edilmiştir.

Enteropatojenik E. coli’ye Maruz Kalma Yolları

Enfeksiyon, aşağıdakilerle ilişkilendirilir:

• Kişiden kişiye bulaşma: Özellikle bakım evleri ve kreşler gibi bireyler arasında yakın temasın olduğu topluluklarda yaygındır.
• Hayvanlarla temas: Çiftlik hayvanları, özellikle de büyükbaş hayvanlarla temas, EHEC suşlarının yayılmasında rol oynayabilir.
• Gıda: Pişmemiş kıyma, çiğ süt, kontamine edilmiş sebzeler ve pastörize edilmemiş meyve suları gibi gıdalar, enteropatojenik E. coli’yi bulaştırabilir.
• Kontamine su tüketimi: Kirli su kaynakları, özellikle gelişmekte olan ülkelerde, enteropatojenik E. coli’nin önemli bir bulaşma yoludur.

Kişisel hijyen uygulamaları, uygun gıda hazırlama teknikleri ve güvenli su kaynaklarının kullanımı, enteropatojenik E. coli enfeksiyonlarını önlemenin önemli yollarıdır.

Enteropatojenik E. coli’nin İçme Suyundaki Önemi

Patogenik E. coli’nin su yoluyla bulaşması hem rekreasyonel sular hem de kirli içme suyu için iyi bir şekilde belgelenmiştir. E. coli O157:H7 (ve Campylobacter jejuni) tarafından meydana gelen su kaynaklı hastalık salgınları, Kanada, Ontario’daki Walkerton çiftçilik topluluğunda meydana gelmiştir. Mayıs 2000’de gerçekleşen salgın, 7 kişinin ölümüne ve 2300’den fazla kişinin hastalanmasına neden olmuştur. İçme suyu kaynağı, sığır dışkıları içeren yağmur suyu akıntısı ile kirlenmiştir.

Bir su güvenliği planı içerisinde, enteropatojenik E. coli’den kaynaklanabilecek potansiyel riski yönetmek için uygulanabilecek kontrol önlemleri şunlardır:

• Ham su kaynaklarının insan ve hayvan atıklarından korunması
• Suyun yeterli arıtılması
• Dağıtım sırasında suyun korunması

Enteropatojenik E. coli suşlarının su arıtma ve dezenfeksiyon prosedürlerine verdiği tepkinin diğer E. coli’den farklı olduğuna dair hiçbir işaret yoktur. Bu nedenle, E. coli (veya alternatif olarak termotolerant koliform bakteriler) için yapılan rutin testler, içme suyundaki enteropatojenik serotipler için uygun bir gösterge sağlar. Bu, standart testlerin genellikle EHEC suşlarını tespit etmeyeceği durumlarda bile geçerlidir.

Seçilmiş Kaynakça

• Nataro JP, Kaper JB (1998) İshal Yoluyla Bulaşan Escherichia coli. Klinik Mikrobiyoloji Derlemeleri, 11: 142-201.
• O’Connor DR (2002) Walkerton Soruşturması Raporu: Mayıs 2000 Olayları ve İlgili Konular. Bölüm 1: Bir Özet. Toronto, Ontario, Ontario Başsavcılık Bakanlığı, Ontario Kraliçe Matbaası.

Kısaltmaların İngilizce ve Türkçe Anlamları

• 2,4-D: 2,4-dichlorophenoxyacetic acid – 2,4-D: 2,4-diklorofenoksiasetik asit
• 2,4-DB: 2,4-dichlorophenoxybutyric acid – 2,4-DB: 2,4-diklorofenoksibutirik asit
• 2,4-DP: dichlorprop – 2,4-DP: diklorprop
• 2,4,5-T: 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid – 2,4,5-T: 2,4,5-triklorofenoksiasetik asit
• 2,4,5-TP: 2,4,5-trichlorophenoxy propionic acid; fenoprop – 2,4,5-TP: 2,4,5-triklorofenoksi propiyonik asit; fenoprop
• AAS: atomic absorption spectrometry – AAS: atomik absorpsiyon spektrometresi
• Absor: absorptiometry – Absor: absorpsiyometri
• ADI: acceptable daily intake – ADI: kabul edilebilir günlük alım miktarı
• AES: atomic emission spectrometry – AES: atomik emisyon spektrometresi
• AIDS: acquired immunodeficiency syndrome – AIDS: Edinilmiş Bağışıklık Yetmezliği Sendromu
• AMPA: aminomethylphosphonic acid – AMPA: aminometilfosfonik asit
• ARfD: acute reference dose – ARfD: akut referans dozu
• ATX: anatoxin – ATX: anatoksin
• BDCM: bromodichloromethane – BDCM: bromodiklorometan
• BMD: benchmark dose – BMD: referans dozu
• BMDL: lower confidence limit on the benchmark dose – BMDL: kıyaslama dozunda daha düşük güven sınırı
• BMDLx: lower 95% confidence limit on the benchmark dose for an x% response – BMDLx: %x yanıt için referans dozda %95’lik daha düşük güven sınırı
• BTEX: benzene, toluene, ethylbenzene and xylenes – BTEX: benzen, toluen, etilbenzen ve ksilenler
• Bti: Bacillus thuringiensis israelensis – Bti: Bacillus thuringiensis israelensis
• bw: body weight – bw: vücut ağırlığı
• CAS: Chemical Abstracts Service – CAS: Kimyasal Özetler Hizmeti
• Col: colorimetry – Col: kolorimetri
• CPVC: chlorinated polyvinyl chloride – CPVC: klorlu polivinil klorür
• CSAF: chemical-specific adjustment factor – CSAF: kimyasala özgü ayarlama faktörü
• Ct: product of disinfectant concentration and contact time – Ct: dezenfektan konsantrasyonunun ve temas süresinin çarpımı
• CYN: cylindrospermopsin – CYN: silindirdrospermopsin
• DAEC: diffusely adherent E. coli – DAEC: yaygın olarak yapışan E. coli
• DALY: disability-adjusted life year – DALY: engelliliğe göre ayarlanmış yaşam yılı
• DBCM: dibromochloromethane – DBCM: dibromoklorometan
• DBCP: 1,2-dibromo-3-chloropropane – DBCP: 1,2-dibromo-3-kloropropan
• DBP: disinfection by-product – DBP: dezenfeksiyon yan ürünü
• DCA: dichloroacetic acid – DCA: dikloroasetik asit
• DCB: dichlorobenzene – DCB: diklorobenzen
• DCP: dichloropropane – DCP: dikloropropan
• DDT: dichlorodiphenyltrichloroethane – DDT: diklorodifeniltrikloroetan
• DEHA: di(2-ethylhexyl)adipate – DEHA: di(2-etilheksil)adipat
• DEHP: di(2-ethylhexyl)phthalate – DEHP: di(2-etilheksil)ftalat
• DNA: deoxyribonucleic acid – DNA: deoksiribonükleik asit
• DPD: N,N-diethyl-1,4-phenylenediamine sulfate – DPD: N,N-dietil-1,4-fenilendiamin sülfat
• EAAS: electrothermal atomic absorption spectrometry – EAAS: elektrotermal atomik absorpsiyon spektrometrisi
• EAEC: enteroaggregative E. coli – EAEC: enteroagregatif E. coli
• ECD: electron capture detector – ECD: elektron yakalama dedektörü
• EDTA: ethylenediaminetetraacetic acid; edetic acid – EDTA: etilendiamintetraasetik asit; edetik asit
• EHEC: enterohaemorrhagic E. coli – EHEC: enterohemorajik E. coli
• EIEC: enteroinvasive E. coli – EIEC: enteroinvazif E. coli
• ELISA: enzyme-linked immunosorbent assay – ELISA: enzime bağlı immünosorbent tahlili
• EPEC: enteropathogenic E. coli – EPEC: enteropatojenik E. coli
• ETEC: enterotoxigenic E. coli – ETEC: enterotoksijenik E. coli
• F₀: parental generation – F₀: ebeveyn nesli
• F₁: first filial generation – F₁: ilk evlat nesli
• FAAS: flame atomic absorption spectrometry – FAAS: alevli atomik absorpsiyon spektrometresi
• FAO: Food and Agriculture Organization of the United Nations – FAO: Birleşmiş Milletler Gıda ve Tarım Örgütü
• FD: fluorescence detector – FD: floresans dedektörü
• FID: flame ionization detector – FID: alev iyonizasyon dedektörü
• FPD: flame photodiode detector – FPD: alev fotodiyot dedektörü
• GAC: granular activated carbon – GAC: granüler aktif karbon
• GC: gas chromatography – GC: gaz kromatografisi
• GL: guidance level (used for radionuclides in drinking-water) – GL: kılavuz seviyesi (içme suyundaki radyonüklidler için kullanılır)
• GV: guideline value – GV: kılavuz değer
• HAA: haloacetic acid – HAA: haloasetik asit
• HAV: hepatitis A virus – HAV: hepatit A virüsü
• HCB: hexachlorobenzene – HCB: heksaklorobenzen
• HCBD: hexachlorobutadiene – HCBD: hekzaklorobutadien
• HCH: hexachlorocyclohexane – HCH: hekzaklorosikloheksan
• HEV: hepatitis E virus – HEV: hepatit E virüsü
• HIV: human immunodeficiency virus – HIV: insan bağışıklık yetersizliği virüsü
• HPC: heterotrophic plate count – HPC: heterotrofik plaka sayısı
• HPLC: high-performance liquid chromatography – HPLC: yüksek performanslı sıvı kromatografisi
• IARC: International Agency for Research on Cancer – IARC: Uluslararası Kanser Araştırma Ajansı
• IC: ion chromatography – IC: iyon kromatografisi
• ICP: inductively coupled plasma – ICP: indüktif olarak eşleşmiş plazma
• ICRP: International Commission on Radiological Protection – ICRP: Uluslararası Radyolojik Koruma Komisyonu
• IDC: individual dose criterion – IDC: bireysel doz kriteri
• IPCS: International Programme on Chemical Safety – IPCS: Uluslararası Kimyasal Güvenlik Programı
• IQ: intelligence quotient – IQ: zeka bölümü
• ISO: International Organization for Standardization – ISO: Uluslararası Standardizasyon Örgütü
• JECFA: Joint FAO/WHO Expert Committee on Food Additives – JECFA: Gıda Katkı Maddeleri Ortak FAO/WHO Uzman Komitesi
• JMPR: Joint FAO/WHO Meeting on Pesticide Residues – JMPR: Pestisit Kalıntılarına İlişkin FAO/WHO Ortak Toplantısı
• LC: liquid chromatography – LC: sıvı kromatografisi
• LOAEL: lowest-observed-adverse-effect level – LOAEL: gözlemlenen en düşük yan etki düzeyi
• LRV: log₁₀ reduction value – LRV: log₁₀ azaltma değeri
• MC: microcystin – MC: mikrosistin
• MCB: monochlorobenzene – MCB: monoklorobenzen
• MCPA: 4-(2-methyl-4-chlorophenoxy)acetic acid – MCPA: 4-(2-metil-4-klorofenoksi)asetik asit
• MCPB: 2,4-MCPB; 4-(4-chloro-o-tolyloxy)butyric acid; 4-(4-chloro2 methylphenoxy)butanoic acid – MCPB: 2,4-MCPB; 4-(4-kloro-o-toliloksi)bütirik asit; 4-(4-kloro2 metilfenoksi)bütanoik asit
• MCPP: 2(2-methyl-chlorophenoxy) propionic acid; mecoprop – MCPP: 2(2-metil-klorofenoksi) propiyonik asit; mekoprop
• MDL: method detection limit – MDL: yöntem tespit limiti
• MMT: methylcyclopentadienyl manganese tricarbonyl – MMT: metilsiklopentadienil manganez trikarbonil
• MS: mass spectrometry – MS: kütle spektrometresi
• MS/MS: tandem mass spectrometry – MS/MS: tandem kütle spektrometresi
• MTBE: methyl tertiary-butyl ether – MTBE: metil üçüncül-bütil eter
• MX: 3-chloro-4-dichloromethyl-5-hydroxy-2(5H)-furanone – MX: 3-kloro-4-diklorometil-5-hidroksi-2(5H)-furanon
• NDMA N-nitrosodimethylamine – NDMA N-nitrosodimetilamin
• NOAEL: no-observed-adverse-effect level – NOAEL: advers etkinin gözlemlenmediği düzey
• NOEL: no-observed-effect level – NOEL: etki gözlemlenmeyen düzey
• NTA: nitrilotriacetic acid – NTA: nitrilotriasetik asit
• NTP: National Toxicology Program (USA) – NTP: Ulusal Toksikoloji Programı (ABD)
• NTU: nephelometric turbidity unit – NTU: nefelometrik bulanıklık birimi
• PAC: powdered activated carbon – PAC: toz aktif karbon
• PAH: polynuclear aromatic hydrocarbon – PAH: polinükleer aromatik hidrokarbon
• PCE: tetrachloroethene – PCE: tetrakloroeten
• PCP: pentachlorophenol – PCP: pentaklorofenol
• PCR: polymerase chain reaction – PCR: polimeraz zincir reaksiyonu
• PD: photoionization detector – PD: fotoiyonizasyon dedektörü
• PDA: photodiode array – PDA: fotodiyot dizisi
• PMTDI: provisional maximum tolerable daily intake – PMTDI: geçici maksimum tolere edilebilir günlük alım miktarı
• PPA: protein phosphatase assay – PPA: protein fosfataz tahlili
• PT: purge and trap – PT: arındır ve tuzağa düşür
• PTDI: provisional tolerable daily intake – PTDI: geçici tolere edilebilir günlük alım
• PTMI: provisional tolerable monthly intake – PTMI: geçici tolere edilebilir aylık alım
• PTWI: provisional tolerable weekly intake – PTWI: geçici tolere edilebilir haftalık alım
• PVC: polyvinyl chloride – PVC: polivinil klorür
• QMRA: quantitative microbial risk assessment – QMRA: niceliksel mikrobiyal risk değerlendirmesi
• RNA: ribonucleic acid – RNA: ribonükleik asit
• SI: Système international d’unités (International System of Units) – SI: Système uluslararası d’unités (Uluslararası Birim Sistemi)
• SODIS: solar water disinfection – SODIS: güneş enerjisiyle su dezenfeksiyonu
• STX: saxitoxin – STX: saksitoksin
• sp.: species (singular) – sp.: türler (tekil)
• spp.: species (plural) – spp.: türler (çoğul)
• subsp.: subspecies (singular) – subsp.: alt tür (tekil)
• TBA: terbuthylazine – TBA: terbutilazin
• TCB: trichlorobenzene – TCB: triklorobenzen
• TCE: trichloroethene – TCE: trikloroeten
• TCU: true colour unit – TCU: gerçek renk birimi
• TD₀₅: tumorigenic dose05 , the dose associated with a 5% excess incidence of tumours in experimental animal studies – TD₀₅: tümörijenik doz₀₅, deneysel hayvan çalışmalarında tümör vakalarının %5 fazla olmasıyla ilişkili doz
• TDI: tolerable daily intake – TDI: tolere edilebilir günlük alım miktarı
• TDS: total dissolved solids – TDS: toplam çözünmüş katılar
• THM: trihalomethane – THM: trihalometan
• TID: thermal ionization detector; total indicative dose – TID: termal iyonizasyon dedektörü; toplam gösterge dozu
• UF: uncertainty factor – UF: belirsizlik faktörü
• UN: United Nations – BM: Birleşmiş Milletler
• UNICEF: United Nations Children’s Fund – UNICEF: Birleşmiş Milletler Çocuklara Yardım Fonu
• UNSCEAR: United Nations Scientific Committee on the Effects of Atomic Radiation – UNSCEAR: Birleşmiş Milletler Atomik Radyasyonun Etkileri Bilimsel Komitesi
• USA: United States of America – ABD: Amerika Birleşik Devletleri
• UV: ultraviolet – UV: ultraviyole
• UVPAD: ultraviolet photodiode array detector – UVPAD: ultraviyole fotodiyot dizisi dedektörü
• WHO: World Health Organization – DSÖ: Dünya Sağlık Örgütü
• WHOPES: World Health Organization Pesticide Evaluation Scheme – WHOPES: Dünya Sağlık Örgütü Pestisit Değerlendirme Planı
• WSP: water safety plan – WSP: su güvenliği planı
• YLD: years of healthy life lost in states of less than full health (i.e. years lived with a disability) – YLD: Sağlığın tam olmadığı durumlarda kaybedilen sağlıklı yaşam yılları (yani engellilikle geçirilen yıllar)
• YLL: years of life lost by premature mortality – YLL: Erken ölüm nedeniyle kaybedilen yaşam yılları